(l）按形状分为三类，有球菌、杆菌和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺杆菌和丝状菌）。

(2）按细菌的生活方式来分，分为自养菌和异养菌两大类，其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。

(3）按细菌对氧气的需求来分，可分为需氧（完全需氧和微需氧）和厌氧（不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧）细菌。

(4）按细菌生存温度分，可分为喜冷、常温和喜高温三类。