无论好氧微生物细胞还是厌氧微生物细胞，其主要组成物质都是C、H、O、N、P等元素，另外还有S、Na、K、Mn、Mg等无机元素。其中N是构成微生物体的重要元素，可占菌体干重的10%，菌体蛋白质、核酸等分子中都有N元素。氨态氮比较容易被细菌利用，因此在生物法处理缺氮污水时，可以向水中投加尿素、碳按类农用化肥。P、S是细菌核酸的重要组分，可占菌体干重的l％一2%, S还是污泥中自养型硫细菌的能源，无机元素是某些细菌生理活动所必需的。

工业污水往往会出现N、P、S及某些微量元素比例过低或缺少而影响生物处理效果的情况，只有设法保持进水中N、P和一些无机盐含量适中，才能保证微生物的活性，进而确保生物处理效果。