活性污泥法系统的设计和运行有若干关键性问题，认识和理解这些问题对系统的影响，显得十分重要。它们是：水力负荷；有机负荷；微生物浓度；曝气时间；微生物平均停留时间；氧传递速率；回流污泥浓度；回流污泥率；曝气池构造；声值和碱度；溶解氧浓度。