各种汞化合物的毒性差别很大。无机汞中的氯化汞是剧毒物质，有机汞中的苯基汞分解较快，毒性不大；甲基汞毒性最大，进人人体很容易被吸收，不易降解，排泄也慢，容易在脑中积累，如水误病就是由甲基汞中毒造成的。

从污水中去除无机汞的方法有硫化物沉淀法、化学凝聚法、活性炭吸附法、金属还原法、离子交换法和微生物法等。一般偏碱性含汞污水通常采用化学凝聚法或硫化物沉淀法处理。偏酸性的含汞污水可用金属还原法处理。低浓度的含汞污水可用活性炭吸附法、化学凝聚法或活性污泥法处理，有机汞污水较难处理，通常先将有机汞氧化为无机汞，再进行处理。