AB法A段的正常运行，必须有足够的已经适应待处理污水性质的微生物，因为A段去除率的高低与进水微生物量直接相关，这也是A段之前不设初沉池的原因，因此AB法适用于处理城市污水和含有城市污水的混合污水。

对于工业污水或某些工业污水比例较高的城市污水，由于其中适应污水环境的微生物浓度很低，使用AB法时A段效率会明显降低，A段作用只相当于初沉池，对这类污水不宜采用AB法。另外，未进行有效预处理或水质变化较大的污水也不适宜使用AB法处理，因为在这样的污水管网系统中，微生物不宜生长繁殖，直接导致A段的处理效果因外源微生物的数量较少而受到严重影响。