(1）化学法除磷最大的间题是会使污泥量显著增加，因为除磷时产生的金属磷酸盐和金属氢氧化物以悬浮固体的形式存在于水中，称为物化污泥。在初沉池前投加金属盐，初沉池污泥可以增加60％一100%，整个污水处理厂污泥量增加60％、70％。在二级处理过程中投加金属盐，剩余污泥量会增加35％一45%，由此会增加处理厂污泥处理与处置的难度。

(2）化学除磷不仅使污泥量增加，而且使活性污泥浓度降低。

(3）铁盐除磷有时会使出水呈微红色。