(1）进水COD的构成发生变化

对于不同质的底物，去除1kgCOD的产气量是有差异的。就厌氧分解等量COD的不同有机物而言，脂类物质的产气量最多，其中甲烷量也高；蛋白质所产生的沼气数量虽少，但甲烷含量高；碳水化合物所产生的沼气量少，而且甲烷含量也较低。通常所称的理论产气率是以碳水化合物厌氧分解计算，每去除1kgCOD可以产生0.35m³左右的甲烷或0.7m³左右的沼气。沼气产量偏低，有可能是污水中脂类物质的含量在COD中的比例下降造成的。

(2）进水COD浓度下降

污水中COD浓度越低，单位有机物的甲烷产率越低。

(3）生物相的影响

如果厌氧处理反应器内硫酸盐还原菌及反硝化细菌数量较多，就会和甲烷菌争夺碳源，进而导致产气率下降。因此污水中硫酸盐含量越大，沼气产率下降越多。

(4）运行条件发生变化

对于同种污水，沼气产率下降往往意味着实际运行的工艺条件发生了不利的变化。比如pH调节不利使pH值偏离了最佳范围，保温不好或加热措施失效使反应器内温度降低太多。