UNITANK两段好氧系统是由两个相邻的矩形反应池组成的，每个反应池被分成三个单元部分。每个反应器代表一个氧化阶段。UNITANK两段好氧系统是由一个高负荷段和一个低负荷段组成的。在第一一个高负荷段,能够获得75% ~85%的BOD去除率，而在经过低负荷段后总的去除率为98%~99%。UNITANK两段好氧是由两个串联的UNITANK单段系统组成,如下图所示。

高负荷段和低负荷段的不同可实现微生物群体的不同。高负荷段的微生物群落是由快速生长的细菌种群组成的。它们能够以一种非常有效的方式适应环境（污泥负荷、基质、温度、pH等）的变化。它们仅消耗可生物降解的有机物。此段具有短污泥停留时间的特点。

在其后的低负荷段的反应器内是缓慢生长的细菌群落。它们能有效地降解低浓度的、较难生物降解的有机物。反应器内自由游动的细菌被原生动物所捕食，因此，出水的悬浮固体和BOD浓度是很低的。此段具有长污泥停留时间的特点。

在负荷极度变化和毒物的冲击下，第一段是一个理想的缓冲器。通过第一段（高负荷段）的运行，可保护第二段（低负荷段）中更加敏感的细菌免受有机物超负荷和毒物冲击的影响，从而获得高质量的出水。