UNITANK系统的甲烷反应器是个上向流的反应器（见下图）。

反应器内实现污泥和废水的良好混合和接触是通过：①因生成生物气而在反应器内获得自然的搅拌；②系统进水口的特殊设计，使得废水在反应器的底部进行均匀地分配。废水经泵抽送至反应器的底部。在反应器内，厌氧生物污泥将有机化合物降解为生物气，主要是CH4和CO：的混合气体，并生成少量的新污泥。在进行了生物气和污泥一水混合物的分离以后，废水流到一体的沉淀池中。在这里污泥进行沉降并重新循环至反应器。处理的废水在反应器的顶部经出水堰流出。