厌氧消化工艺有多种分类方法。按微生物生长状态分为厌氧活性污泥法和厌氧生物膜法；按投料、出料及运行方式分为分批式、连续式和半连续式；根据厌氧消化中物质转化反应的总过程是杏在同一反应器中并在同一工艺条件下完成，又可分为一步厌氧法与两步厌氧法等。

其中，厌氧活性污泥法包括普通消化池、厌氧接触法、上流式厌氧污泥床反应器等。厌氧生物膜法包括厌氧生物滤池、厌氧流化床、厌氧生物转盘等。