由于污泥床中的污泥量比悬浮层大，污染物浓度高，酶的活性也高，有机物的代谢速度较快，因此，大部分有机物在污泥床中被去除。研究结果表明，废水通过污泥床后已有80％以上的有机物被转化，余下的再通过污泥悬浮层处理，有机物总去除率达90%以上。虽然悬浮层去除的有机物量不大，但是其高度的大小对混合程度、产气量和过程稳定性至关重要。因此，应保持有适当悬浮层，保证反应区高度。