脉冲澄清池的工作过程可分为两个阶段，从进水室水位开始上升到虹吸作用开始称为充水阶段，由虹吸作用开始到虹吸作用破坏称为放水阶段。

在充水阶段，原水进人钟罩内的进水室。在放水阶段，进水室内的水通过钟罩，从中央管，落水并进人配水渠道，然后进人带有穿孔的配水渠道，再进人带有穿孔的配水管（配水管的斜下方钻有成排小孔），水从小孔高速喷出（一般流速为2m/s一4m/s)，在每个穿孔配水管的上面装有稳流板，它的作用是让水流均匀平稳的上升，在上升水流的作用下将已沉下来的泥渣悬浮起来，水流从悬浮泥渣层通过，废水中的悬浮物被截留。随着进水室水位下降，悬浮泥渣层的上升流速逐渐减小，当进水室水位降到一定高度时，虹吸破坏，进水室又出现真空，充水阶段又重新开始，充水时悬浮泥渣层下降，就这样周期性的循环工作。通过悬浮泥渣层后的清水经穿孔集水管到集水槽，最后汇集起来送出池外。在悬浮泥渣层上升和下降的过程中，到达泥渣浓缩室边缘高度的部分泥渣就进人浓缩室，经浓缩后由排泥管定期排出。