水和废水中都含有一定数量的微生物，有的对人体健康有害。消毒的目的是杀灭致病微生物，防止水致疾病的危害，但并不是彻底杀灭细菌。

氧化剂消毒至少包括两种途径：

(1）消毒剂通过细胞壁渗入细胞体，灭活细胞体内的酶蛋白；

(2）直接氧化细胞质。