高锰酸盐也是一种强氧化剂，能与水中的Fe²⁺、Mn²⁺、S^2-、CN^-、酚及其他致臭致味有机物很好地反应，选择适当投量，它能杀死很多藻类和微生物。与臭氧处理一样，出水无异味。其投加与监测均很方便。

国内研究用高锰酸钾去除地面水中的有机物。试验发现，在中性pH值条件下，对有机物和致突变物质的去除率均很高，明显优于在酸性和碱性条件下的效果。反应过程中生产的新生态水合MnO₂具有催化氧化和吸附作用。用高锰酸钾作为氯氧化的预处理，可以有效地控制氯酚与氯仿的形成。