（1）促进絮凝和沉凝：原生动物分泌的粘液能促使细菌发生絮凝作用。

（2）减少剩余污泥：原生动物扑食细菌就会使生物量减少，减少的部分等于被氧化量。

（3）改善水质：原生动物出了吞噬游离细菌外，沉降过程中还会粘附和裹带细菌，从而提高细菌的去除率，还可摄取可溶性有机物与细菌一起吞噬水中的病毒。